Авторству Президента Русского географического общества Сергея Шойгу принадлежат, как минимум, два крупнейших археологических проекта на территории Тувы.

Первый – это раскопки останков древнеуйгурской крепости Пор-Бажын, которые стали первыми масштабными археологическими работами постсоветского периода. Пор – Бажын, который переводится с тувинского языка как «глиняный дом», – один из древнейших в стране памятник истории, датируемый VIII веком. Раскопки Пор-Бажына начались летом 2007 года под эгидой возглавляемого тогда Сергеем Шойгу МЧС России. Помимо археологов в экспедиции приняли участие тысячи студентов со всей России. В первый сезон раскопок экспедицию посетили Президент России Владимир Путин и принц Монако Альбер II.

Однако всему миру проект стал известен другой стороной - методами исследований, которые не имели аналогов в истории отечественной и зарубежной науки.

Впервые археологическое изучение памятника включило все современные естественнонаучные методы (геофизические, гидрологические, почвенные, планиметрические), которые позволили получить и сохранить обширную и разнообразную информацию о памятнике. Подобный комплекс естественнонаучных исследований в применении к археологии до сих пор не проводился в таком объеме не только в отечественной, но и в мировой практике. С этой точки зрения проект признается учеными как совершенно новый шаг в развитии науки.

На основе проекта «Пор-Бажын» благодаря энтузиазму и заинтересованности Сергея Шойгу была образована некоммерческая организация – Культурный фонд «Пор-Бажын», которая впоследствии сыграла существенную роль в сохранении памятников истории и культуры на территории Тувы.

В частности, фонд Шойгу стал главным спонсором восстановления главного буддийского храма Тувы – Верхне-Чаданского монастыря «Устуу-Хурээ», разрушенного в прошлом веке. Сергей Шойгу, для которого город Чадан является родным, принимал личное участие в возрождении храма.

Кроме того, фонд «Пор-Бажын» вместе с Шойгу осуществил еще ряд просветительских проектов, направленных на изучение историко-культурного наследия Тувы.

Так, Сергей Шойгу стал вдохновителем издания книги «Загадочная Тува» советского и российского востоковеда-тюрколога Севьяна Вайнштейна. Книга основана на полевых дневниках, которые её автор, известный исследователь Тувы, вел свыше тридцати лет в своих этнографических и археологических экспедициях. В ней показан неповторимый мир Тувы с её уникальной историей и загадочной культурой.

Под редакцией Сергея Кужугетовича была также издана семитомная антология работ крупнейших российских востоковедов о Туве – «Урянхай. Тыва дептер». В сборнике представлены рукописи, статьи, и книги, охватывающие историю тувинского народа начиная со II тысячелетия до н.э. до конца XIX века. Многие исследования сохранились только в крупных библиотеках и музеях России в единичных экземплярах, в такой же степени уникальны и фотографические свидетельства тувинской истории.

В 2010 году фонд «Пор-Бажын» и Сергей Шойгу выпустили фотоальбом «Черно-белая Тува. Незаконченая история…», посвященный истории тувинского народа. В нем в хронологической последовательности собраны фотографии, наиболее полно отразившие развитие республики в конце XIX-XX вв., ярчайшие страницы ее истории и культуры.

Основную часть работы по поиску снимков, составлению комментариев, а также разработке дизайнерской концепции издания взяли на себя сотрудники фонда «Крепость Пор-Бажын».

По инициативе Сергея Шойгу начала издаваться книжная серия «Жизнь замечательных людей Тувы», призванная ознакомить широкий круг читателей с выдающимися историческими личностями Тувы, оставить их имена и образы для будущих поколений. Через линию судьбы и жизни замечательных людей представлены яркие страницы истории и культуры Тувы. При грантовой поддержке Русского географического общества издано уже три тома из серии «Жизнь замечательных людей Тувы: «Максим Мунзук», «Владимир Оскал-оол», «Иннокентий Сафьянов».

В канун 70-летия Победы в Великой Отечественной войны 1941-1945 годов в свет вышел новый труд министра обороны – альбом «Тува – фронту», содержащий уникальные документы, публикующиеся впервые, собранные в фондах Российского госархива социально-политической истории и Центрального архива Министерства обороны РФ. Книга посвящена огромному вкладу Тувинской Народной Республики в победу Советского Союза над немецким фашизмом. Вклад этот, учитывая численность населения, не превышавшую 100 тысяч человек, и уровень развития материально-технической базы, не идет ни в какое сравнение с помощью Советскому Союзу со стороны других его союзников. Первыми обладателями книги-альбома стали ветераны республики.

Современному обществу необходимы знания о предыдущих поколениях, тиражирование их положительного жизненного опыта способствует сохранению историко-культурного наследия народов России.

Также вышла в свет уникальная книга о Туве, автором-составителем которой является Сергей Шойгу. Книга представляет собой коллекцию исторических, географических и этнографических карт Тувы, составленных в разные времена и о разных периодах края – со времен чингизидов и до начала ХХ века. Автор назвал ее «Урянхай – Танну-Тыва. Историческая картография». Коллекционное собрание пока отпечатано в единственном экземпляре.

Второй крупный научный проект, инициированный Сергеем Шойгу на посту Президента РГО, - археологическая экспедиция «Кызыл – Курагино», цель которой – исследовать памятники истории на протяжении всего маршрута строящейся железнодорожной линии из Тувы к Транссибу. Будущая дорога проляжет в непосредственной близости от знаменитых сегодня на весь мир тувинских курганов Аражаан-I и Аржаан-II, благодаря которым на территории республики открыты самые ранние на Земле свидетельства древнейшей цивилизации – скифов. Поэтому РГО выступило за тщательное изучение всей отведенной под строительство ж/д земли на протяжении более чем 400 км.

Проект реализуется на обширной территории, охватывающей два российских региона – Туву и Красноярский край. Для его реализации привлекаются фундаментальные научные, финансовые, организационные ресурсы.

По характеристике самого Шойгу, проект «Кызыл – Курагино» – это не просто экспедиция, а комплексная программа, которая объединяет несколько важнейших для общества направлений деятельности. Тут и строительство железной дороги, и мероприятия по охранно-спасательной археологии, и развитие патриотического воспитания современной молодежи, и привлечение внимания к истории своей страны.

Как и в случае с раскопками уйгурской крепости, этот проект решает и прикладные задачи.

В частности, параллельно с археологической работой идет изучение палеогеографической и палеоэкологической информации, хранящейся в недрах тувинской земли. Она может помочь в решении проблемы глобального изменения климата, в выборе стратегии устойчивого развития региона. Помимо прочего, экспедиция «Кызыл – Курагино» – это возможность напомнить об исследованиях таких известных археологов, как Сергей Теплоухов, Михаил Грязнов, Александр Грач, который возглавлял крупнейшую в стране Саяно-Тувинскую экспедицию, этнограф и археолог Севьян Вайнштейн, а также вспомнить важнейшие достижения и находки Тувинской земли, включая знаменитое золото скифов в Долине царей.